烟台十三中建校于 1972 年，第一次校址位于西盛街26 号，学校占地 8.1 亩，校舍建筑面积 3542平方米 。
1994 年烟台汽车站扩建，学校于同年 9 月搬迁，第二次校址位于前进路 3 号，占地 25 亩，校舍建筑面积 6888平方米 。烟台第十三中学本数据来源于百度地图，最终结果以百度地图数据为准。
2003 年烟台市暨芝罘区人民政府对通伸小区全面改造，学校于同年 5 月搬入现校址—芝罘区通伸南街 40 号。学校占地 21 亩，校舍建筑面积 9200平方米。[1]
办学理念三十多年来，烟台十三中在市、区两级人民政府及教育行政部门的正确领导下，始终坚持了以人为本、全面发展的原则，牢固树立了“教学中心、质量第一”的思想意识，全面贯彻了党的教育方针，烟台第十三中学[2]全面提高了教育教学质量，在培养学生学会学习、学会合作、学会生存、学会做人，关注“全人”发展等方面取得可喜的成绩，各项工作均走在芝罘区教育的前列。[3]
成绩荣誉在教学工作方面，连续多年中考质量名列市区前五名，得到社会的肯定和认可。在德育工作方面，学校重视学生思想道德情操的培养，开展了“爱祖国、爱家乡、爱学校、爱同学”的四爱教育活动，对学生扎扎实实地实施了德育序列化教育，增强了学生自尊、自爱、自立、自强的意识，促进了学生健康成长。在体育工作方烟台第十三中学举行消防应急演练[4]面，烟台十三中是全市中小学体育工作的排头兵，自 1980 年以来，连续30年夺得芝罘区中小学田径运动会冠军，累计向上级体校、体工队输送人才达 150 人之多，多次被评为“烟台市体育工作先进单位”，“山东省体育工作先进单位”，“山东省优秀体育传统项目学校”，国家级“体育工作先进单位”，体育工作已铸就烟台十三中的办学特色。在综合管理方面，烟台十三中被上级教育行政部门命名为“烟台市规范化学校”、“烟台市电化教学示范学校”、“烟台市绿化先进单位”、“烟台市德育工作先进单位”、“烟台市文明单位”。[3]
办学总体目标搞科研 争一流 创名校[3]
发展目标端正教育思想，坚持教育改革，加强学校管理，强化目标意识，发扬十三中的优良传统，保持十三中在全区教育的领先地位，把十三中办成高质量、高效益、高声誉的各项工作能在全市起示范作用的特色学校。[3]
激励目标烟台十三中——“三园”式学校—— 21 世纪建设者成长的摇篮。烟台十三中2011年秋季田径运动会[5] 花园：创设最整洁优美的育人环境。乐园：使学校成为学生最向往的地方。