哈尔滨医科大学是由原哈尔滨医科大学（我国医学先驱伍连德博士于1926年创建的哈尔滨医学专门学校，1938年改名为哈尔滨医科大学）和原兴山（现鹤岗市）中国医科大学第一、二分校（其前身为中国共产党于1931年在江西瑞金建立的中国工农红军卫生学校）组建而成。
学校历经90年的发展建设，传承了伍连德博士“赤诚爱国、自强创业”的精神，发扬了中国工农红军卫校“政治坚定、技术优良”的光荣传统，秉承“木直中绳、博学载医”的校训，综合实力不断增强。具有相当的发展规模和鲜明的办学特色，已经跻身于全国高等医学院校前列，是黑龙江省重点建设高水平大学、中俄医科大学联盟中方牵头单位、部委省共建大学。
学校设有基础医学院、公共卫生学院、卫生管理学院、药学院、生物信息科学与技术学院、人文社会科学学院、马克思主义学院、体育学部、哈尔滨医科大学第一至第四临床医学院、眼科医学院、口腔医学院、护理学院、麻醉学系、重症医学系、医学影像学系、儿科医学系、五官科学系、病理学系、研究生学院、成人与继续教育学院、国际教育学院等24所二级院系；设有哈尔滨医科大学大庆分校、中国疾病预防控制中心地方病控制中心、黑龙江省医学科学院、哈尔滨医科大学附属第一至第四医院（挂哈尔滨医科大学第一至第四临床医学院牌子）、哈尔滨医科大学血液肿瘤医院等8所事业单位。
全校现有教职工17249人，中国工程院院士1人，中国工程院医药卫生学部主任委员1人，获南丁格尔奖1人，国务院学科评议组成员3人，教育部高等学校教学指导委员会委员13人，全国医学专业学位研究生教育指导委员会委员3人，国家级教学名师4人，“国家杰青”1人,“国家优青”1人,“千人计划”专家2人,“长江学者”特聘教授2人、讲座教授2人、青年学者2人，“万人计划”领军人才2人、“万人计划”青年拔尖人才2人，省“龙江学者”特聘教授32人，享受国务院政府特殊津贴98人。
学校为国家教育部首批试办七年制高等医学教育的院校之一，是国家第一批卓越医生教育培养计划项目的试点高校。校本部普通高等教育设17个专业：基础医学(“5+2”本硕连续培养)、临床医学(五年制、“5+3”一体化、专业硕士儿科学)、口腔医学、儿科学、护理学、麻醉学、药学、预防医学、医学影像学、公共事业管理、法学、生物技术、生物信息学、临床药学、市场营销、卫生监督、生物医学工程。
在校研究生5331人，普通本科生11704人（校本部7987人、大庆校区3717人），普通专科生3122人(大庆校区)，留学生579人。
