山西中医学院是一所年轻的高等中医药院校。学校于1982年由国务院批准筹建。1986年学校接收原山西医学院中医大学班，1989年6月正式挂牌成立，同年开始接受本科生。1999年6月，学校通过了国家教育部组织的本科教学工作合格评估。2002年开始招收留学生。2004年，学校接收了原太原铁路中心医院和太原铁路结核病医院，并改建为山西中医学院中西医结合医院。2007年4月,学校以“良好”的成绩通过了教育部本科教学工作水平评估。2008年2月，学校获得了硕士单位授予权，2009年开始招收硕士研究生。学校现已成为山西省中医药教育、科研、医疗的中心。
建校以来，学校的办学实力不断积累壮大，机构设置日趋合理。学校占地面积174698.46m2，建筑面积137996.40m2。现有固定资产总值1.78亿元，其中教学科研仪器设备总值3656万元。图书馆建筑面积为16200m2，馆藏纸质图书43万册、电子图书近32万册，是山西省中医药信息中心、山西省高等院校图书馆自动化建设乙级馆。校本部设有中医系、针灸推拿系、中药系、护理系、中西医结合临床医学系、基础部、社科部、体育部、计算机教学与网络管理中心、国际教育中心、实验管理中心、成人教育学院等教学单位，有60个教研室，17个教学实验室，4个科研实验室，1个科研实验中心。另有一所办学体制相对独立的专科层次二级学院山西中医学院推拿职业技术学院。
学校以中医药专业为主体，专业建设与学科建设同步发展。现设有中医学、针灸推拿学、中药学、中西医临床医学、护理学5个专业和中医学医学英语、中医学医药信息管理、针灸推拿学英语、中药学中药分析4个专业方向。其中，中医学专业为国家级第一类特色专业建设点，中医学、针灸推拿学、中药学3个专业为省级品牌专业；中医临床基储针灸推拿学、中医医史文献3个学科为硕士学位授权点；中医文献学、方剂学、针灸学、中西医结合临床、中医肾病学5个学科为国家级重点学科；中医基础理论、中西医结合基储针灸推拿学、中医内科学4个学科为省重点扶持学科；中医内科学、中医基础理论、金匮要略3门课程为省级精品课程；针灸针法实验室、中药化学实验室为国家中医药管理局中医药科研实验室（三级），中医临床基础实验室、中医药基因表达调节技术实验室为国家中医药管理局中医药科研实验室（二级），中医学基础实验室为省医学重点实验室，中药化学实验室、针灸学实验室为省级基础课示范实验室。
学校实施人才强校战略，师资队伍健康成长。现有专任教师316人，其中正高职称50人，副高职称97人，高级职称占教师总数的46.52%；硕士以上学位202人，占教师总数的63.92%。有4人享受国务院特殊津贴，8人荣获“山西省教学名师”称号。现有硕士生导师97人，8人被兄弟院校聘为博士生导师。34人担任新世纪全国高等中医药专业规划教材的主编、编委；14人担任全国普通高等教育中医药类精编教材的编委等。